1.医学部党工委是学校党委为了加强对医学部机关、各学院、附属医院领导而派出的机构，在学校党委的授权下开展工作，为学部、学院、附属医院的建设、改革、发展和稳定提供思想、政治和组织保证。
2.医学部党工委在学部建设和发展中发挥政治核心和监督保障作用，保证学部坚持社会主义办学方向，支持学部长正确履行各项职责。
3.传达学习上级精神。通过医学部党政联席会议参与医学部重要事项的讨论与决策。
4.指导协调学部各单位党的建设、思想政治工作和干部队伍建设等工作。
5.督导附属医院落实《吉林省加强公立医院党的建设工作的实施办法》和《吉林大学关于加强附属医院党的建设工作的实施细则》,落实党委领导下的院长负责制，不断提高附属医院党建工作水平。
6.组织开展医学文化建设，承担吉林大学白求恩精神研究中心工作。
7.承担学校党委、学校行政交办的各项工作。